Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg4bQ8BGE6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4bQ8BGE6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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