Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

Predictions only

Length 4,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkhd1l1Q80ZA4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms