Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TnnQ80Z71 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TnnQ80Z71 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TnnQ80Z71 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms