Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp8Q80YR6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms