Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm5bQ80Y84 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm5bQ80Y84 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm5bQ80Y84 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm5bQ80Y84 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm5bQ80Y84 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm5bQ80Y84 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm5bQ80Y84 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm5bQ80Y84 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm5bQ80Y84 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm5bQ80Y84 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm5bQ80Y84 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm5bQ80Y84 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm5bQ80Y84 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm5bQ80Y84 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm5bQ80Y84 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm5bQ80Y84 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm5bQ80Y84 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5bQ80Y84 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm5bQ80Y84 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms