Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrfn4Q80XU8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrfn4Q80XU8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms