Protein–RNA interactions for Protein: Q80VU4

Ntf4, Neurotrophin-4, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf4Q80VU4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms