Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc155Q80VJ8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms