Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lamp3Q7TST5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms