Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
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Clec18aQ7TSQ1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clec18aQ7TSQ1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Clec18aQ7TSQ1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Clec18aQ7TSQ1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Clec18aQ7TSQ1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clec18aQ7TSQ1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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