Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LnpkQ7TQ95 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LnpkQ7TQ95 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms