Protein–RNA interactions for Protein: Q7M760

Zranb1, Ubiquitin thioesterase Zranb1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zranb1Q7M760 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zranb1Q7M760 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zranb1Q7M760 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms