Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox11Q7M6Y2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox11Q7M6Y2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms