Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vma21Q78T54 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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