Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
SynmQ70IV5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SynmQ70IV5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms