Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35Q6ZWV7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms