Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ncapd3Q6ZQK0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ncapd3Q6ZQK0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ncapd3Q6ZQK0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ncapd3Q6ZQK0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ncapd3Q6ZQK0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ncapd3Q6ZQK0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ncapd3Q6ZQK0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms