Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ino80Q6ZPV2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ino80Q6ZPV2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms