Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl3Q6W5C0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 256.7 ms