Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms