Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHU5

Sort1, Sortilin, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sort1Q6PHU5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sort1Q6PHU5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sort1Q6PHU5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sort1Q6PHU5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sort1Q6PHU5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sort1Q6PHU5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sort1Q6PHU5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms