Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gramd2bQ6PEM6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms