Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM2

Srsf1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf1Q6PDM2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf1Q6PDM2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf1Q6PDM2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf1Q6PDM2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf1Q6PDM2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf1Q6PDM2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf1Q6PDM2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf1Q6PDM2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf1Q6PDM2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf1Q6PDM2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf1Q6PDM2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf1Q6PDM2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf1Q6PDM2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf1Q6PDM2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf1Q6PDM2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms