Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbtb39Q6PDK0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbtb39Q6PDK0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms