Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rundc3bQ6PDC0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc3bQ6PDC0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms