Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6PD19 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6PD19 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6PD19 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6PD19 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6PD19 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6PD19 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6PD19 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6PD19 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6PD19 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6PD19 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6PD19 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6PD19 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6PD19 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6PD19 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6PD19 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6PD19 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6PD19 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6PD19 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6PD19 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6PD19 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6PD19 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6PD19 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6PD19 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6PD19 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6PD19 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6PD19 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6PD19 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6PD19 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6PD19 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6PD19 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6PD19 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6PD19 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6PD19 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6PD19 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6PD19 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6PD19 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6PD19 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6PD19 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q6PD19 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q6PD19 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q6PD19 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6PD19 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6PD19 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6PD19 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6PD19 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6PD19 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6PD19 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6PD19 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6PD19 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6PD19 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6PD19 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6PD19 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6PD19 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6PD19 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6PD19 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6PD19 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6PD19 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6PD19 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6PD19 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6PD19 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6PD19 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6PD19 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6PD19 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6PD19 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6PD19 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6PD19 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6PD19 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6PD19 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6PD19 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6PD19 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6PD19 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6PD19 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6PD19 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6PD19 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6PD19 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6PD19 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6PD19 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6PD19 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6PD19 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6PD19 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6PD19 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6PD19 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6PD19 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6PD19 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6PD19 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6PD19 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6PD19 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6PD19 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6PD19 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6PD19 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6PD19 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6PD19 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6PD19 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6PD19 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6PD19 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6PD19 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6PD19 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6PD19 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6PD19 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms