Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkab2Q6PAM0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab2Q6PAM0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms