Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6I6

Polr2m, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2mQ6P6I6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms