Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E8

Efcab6, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab6Q6P1E8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Efcab6Q6P1E8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efcab6Q6P1E8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms