Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Soga3Q6NZL0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Soga3Q6NZL0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms