Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpsf6Q6NVF9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpsf6Q6NVF9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpsf6Q6NVF9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpsf6Q6NVF9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpsf6Q6NVF9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpsf6Q6NVF9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpsf6Q6NVF9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpsf6Q6NVF9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpsf6Q6NVF9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf6Q6NVF9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms