Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Pdcd11Q6NS46 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms