Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hecw2Q6I6G8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hecw2Q6I6G8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hecw2Q6I6G8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hecw2Q6I6G8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hecw2Q6I6G8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hecw2Q6I6G8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hecw2Q6I6G8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hecw2Q6I6G8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hecw2Q6I6G8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hecw2Q6I6G8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hecw2Q6I6G8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hecw2Q6I6G8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Hecw2Q6I6G8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Hecw2Q6I6G8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Hecw2Q6I6G8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hecw2Q6I6G8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hecw2Q6I6G8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hecw2Q6I6G8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms