Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Carmil1Q6EDY6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Carmil1Q6EDY6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms