Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbf1Q6DFZ1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms