Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms