Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms