Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZT1

Fan1, Fanconi-associated nuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fan1Q69ZT1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fan1Q69ZT1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fan1Q69ZT1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fan1Q69ZT1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fan1Q69ZT1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fan1Q69ZT1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fan1Q69ZT1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fan1Q69ZT1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fan1Q69ZT1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fan1Q69ZT1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fan1Q69ZT1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fan1Q69ZT1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fan1Q69ZT1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fan1Q69ZT1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.8 ms