Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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