Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Fgd6Q69ZL1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fgd6Q69ZL1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fgd6Q69ZL1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fgd6Q69ZL1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fgd6Q69ZL1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fgd6Q69ZL1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms