Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK0

Prex1, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex1Q69ZK0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prex1Q69ZK0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Prex1Q69ZK0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms