Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msl2Q69ZF8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms