Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sbno1Q689Z5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sbno1Q689Z5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms