Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp4fQ66X05 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms