Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col4a5Q63ZW6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms