Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms