Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sall3Q62255 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms