Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim27Q62158 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim27Q62158 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms