Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprrQ62132 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprrQ62132 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprrQ62132 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
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PtprrQ62132 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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PtprrQ62132 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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PtprrQ62132 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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PtprrQ62132 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprrQ62132 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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PtprrQ62132 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprrQ62132 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprrQ62132 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprrQ62132 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprrQ62132 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprrQ62132 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprrQ62132 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprrQ62132 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprrQ62132 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprrQ62132 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprrQ62132 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprrQ62132 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprrQ62132 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprrQ62132 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms