Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms